国际阶段

1．递交国际申请
PCT申请包括向PCT受理局提出申请和指定有效成员国，即"指定国"。中国国家知识产权局是PCT指定受理局，只接受中国国民或居民的国际申请，申请人国籍或居所至少有一个是中国。该局接受中文和英文申请。申请提交后，国家知识产权局将对申请文件进行形式审查，确定国际申请日。通过审查后，申请文件将被送交世界知识产权组织国际局和国际检索单位。
2．国际检索
国际检索是一个封闭过程，除明显错误外，申请人与检索单位不交流。检索报告可在优先权日起9个月或检索单位收到申请后3个月内制定，将传送给国际局和申请人，有时不制定检索报告。国际局将在国际申请日满18个月后公布PCT国际专利申请和检索报告，并将送交申请人指定的国家专利局。
3．国际公布
18个月后，国际局会公布国际申请，并发布小册子和公报。公布形式包括纸质和电子版。
4.补充国际检索（可选）
由愿意提供补充检索且未参与主检索的国际检索单位执行，查找进行主检索的国际检索单位因现有技术在语言和技术领域上的多样性而未能检索到的已公布文献。
5．国际初步审查（可选）
该程序只做出初步意见，对指定国没有约束力。申请人可主动修改申请文件，也可能收到国际初步审查单位的书面意见，可陈述观点或修改。优先权日起28个月时，国际初步审查单位会制定国际初步审查报告，并传送给申请人和国际局。
6．注意事项
国际申请的受理、形式审查、国际检索和国际公布属于必须要经过的程序，而国际初步审查程序则是可以根据自己的需求进行选择的。个人或单位向中国专利局提出的国际申请，国际阶段中除国际公布由世界知识产权组织国际局统一进行外，其它程序都在中国专利局里进行。

国家阶段

由于PCT尚未授权国际合作，专利授权任务由各国或地区专利局完成。进入国家阶段的程序需要申请人启动，并在优先权日或申请日起30个月内依据出具的高质量《国际检索报告》和《初步审查报告》了解专利授权前景，以节省费用。申请人需在自优先权日起30个月内向希望获得专利保护的国家或地区递交规定的国际申请译文，缴纳规定的费用，并办理进入所选国家的手续。各国法律规定和专利局审查程序不同，申请人需查询各国专利局官方网站。申请人未能在期限内办理进入国家手续的，需缴纳宽限费后在自优先权日起32个月内办理。没有在自优先权日起19个月内要求国际初步审查的国际申请，其进入国家阶段的期限为自优先权日起20个月；而提出国际初步审查要求的国际申请，进入国家阶段后需要根据各国规定递交国际申请文件的译本，并缴纳规定的国家费用。各国专利局按照其专利法规对专利申请进行审查，并决定是否授予专利权。